Ulrich Elling Lebenslauf | Er ist Gruppenleiter am Institut für Molekulare Biotechnologie (IMBA), das sich vor allem auf die Erforschung embryonaler Stammzellen (ES) und induzierter pluripotenter Stammzellen (iPSCs) konzentriert. Ulrich Elling erhielt seinen Ph.D. 2001 von der Universität Wien.
(iPS). Er hat kürzlich CRISPR-UMI in der renommierten Zeitschrift Nature Methods veröffentlicht, die einen neuen CRISPR / Cas-basierten Ansatz beschreibt, der nach den Worten des Forschers “Screening auf die nächste Stufe bringt”.
Ulrich Elling studierte in Regensburg, Deutschland, und promovierte am European Molecular Biology Laboratory (EMBL) über seine Arbeiten zur Transkriptionsfaktoranalyse mit Maus-Knockout-Modellen.
Er arbeitete als Postdoc im Labor von Josef Penninger, wo er für die Erzeugung haploider embryonaler Stammzellen verantwortlich war. Derzeit ist er Teamleiter am Institut für Molekulare Biotechnologie (IMBA) in Wien, Österreich, wo er seit 1998 tätig ist.
CRISPR / Cas9-basierte DNA-Editierung wird derzeit für eine Vielzahl von Zwecken eingesetzt, einschließlich der Untersuchung der Genfunktion mit Hilfe von genetischen Großscreens.
Die Heterogenität der Zellpopulationen war schon immer die Schwachstelle der Screens, wodurch bestimmte Mutanten als Ausreißer im Gedränge verloren gingen und das Experiment durch ihr Scheitern scheiterten.
Ein “Unique Molecular Identifier (UMI)”, ein kompliziertes Barcode-System, wurde von Elling und seinem Team entwickelt, um die Zellen zu identifizieren, die im Screening-Prozess verwendet wurden.
Die neuartige Technologie von Elling ermöglicht nun die Trennung von Hunderten von unterschiedlichen Klonen von einzelnen Zellen, was die Identifizierung von sich entwickelnden Klonen ermöglicht. Im Vergleich zu herkömmlichen Techniken ist CRISPR-UMI empfindlicher, robuster und in seinen Ergebnissen wiederholbarer.
Forscher könnten die neue Methode in Zukunft für die Untersuchung stochastischer Prozesse in der Biologie wie Zellreprogrammierung, Zelldifferenzierung und Bildung von Metastasen wertvoll finden.
Die Österreichische Akademie der Wissenschaften hat 1998 in Zusammenarbeit mit dem Pharmaunternehmen Boehringer Ingelheim das Institut für Molekulare Biotechnologie (IMBA) als autonome biomedizinische Forschungsorganisation gegründet.
Das Institut beschäftigt rund 220 Mitarbeiter aus mehr als 40 Nationen, die in der Grundlagenforschung tätig sind. Das IMBA arbeitet eng mit dem Forschungsinstitut für Molekulare Pathologie (IMP) zusammen, das als Grundlagenforschungszentrum für Molekulare Pathologie von Boehringer Ingelheim dient.
Beide Institute sind im benachbarten Vienna Biocenter (VBC) untergebracht.In seiner Doktorarbeit an der Universität Regensburg und am European Molecular Biology Laboratory (EMBL) im Stammzellbiologielabor von Mathias Treier und später während seiner Postdoc-Studie in der Gruppe von Josef Penninger am IMBA entwickelte Elling ein starkes Interesse am Screening.
Elling entdeckte, dass “genetische Einzelexperimente ein schwieriges Geschäft sind”, da sie zu oft nicht den gewünschten Phänotyp hervorbringen und eine Hypothese nicht beweisen, wenn sie durchgeführt werden.
CRISPR-Screenings können dieses Problem überwinden, jedoch muss die Identifizierung eines mit einem Merkmal assoziierten Gens durch Zählen einer kleinen Anzahl von sgRNAs in Populationen erfolgen.
Für ihn waren die biologische Komplexität und Hunderte von Mutationen pro Gen, “die ich durch die haploide Genetik so wahnsinnig lieben gelernt habe”, Dinge, die er auf diesem Gebiet vermisste.
Diese große Anzahl von Wiederholungen ermöglichte es den Forschern, die Genfunktion in Tausenden von physiologisch unabhängigen Mutationen zu untersuchen, die durch zufällige Mutagenese erzeugt wurden.
